グランクレバスでの激しい戦いからおよそ１ヶ月。１３都市は壊滅したものの、ミストルティンは奇跡的に破壊をまぬがれており、１３部隊はそこでの待機を命じられていた。
しかしそれ以降、オトナからの連絡は一切なく、コドモたちを監督する立場のハチとナナも接触しようとしてこない。
ミストルティンでは、環境を維持する機能が不具合を起こし、これまでのような快適な暮らしはできなくなっていた。
そんな状況でも、自分たちで工夫しながら日々の生活をこなす１３部隊のコドモたち。
その中には、仲間たちと一緒に笑うゼロツーの姿もあった。